Sous le management par la direction du service, trois départements seront constitués au sein du service de l'oeuvre Notre-Dame :
Département "ressources"
Il aura notamment comme missions de gérer les ressources humaines, budgétaires et financières et d'assurer la communication graphique et le suivi du site internet.
Département "ateliers de la cathédrale"
Il aura en charge toutes les interventions sur la cathédrale et dans les ateliers.
Du point de vue organisationnel, un groupe de référents sera constitué pour assurer un mode de fonctionnement par chantier.